中國投入產出學會成立于1987年3月，由中國人民大學、中國科學院系統科學研究所、國家統計局三個單位聯合發起。1987～1992年間，本會隸屬于中國數量經濟學會，注冊名稱為中國數量經濟學會投入產出分會，1993年5月經民政部批準，正式注冊為全國學術性研究團體——中國投入產出學會。業務主管單位：國家統計局；主辦單位：國家統計局、中國人民大學、中國科學院系統科學研究所。